二代测序——甲基化的定义和概念 定义：甲基化（methylation）是指从活性甲基化合物（如S-腺苷基甲硫氨酸）上将甲基催化转移到其他化合物的过程。在生物系统中，这是一种常见的化学修饰方式，主要涉及在DNA、RNA和蛋白质等生物大分子上添加甲基基团。 DNA甲基化 概念及位置：DNA甲基化主要是在DNA甲基转移酶（...

二代测序的优势和劣势分别有哪些？ 优势：能够同时得到大量的序列数据，相比于一代测序技术，通量提高了成千上万倍;单条序列成本非常低廉。 劣势：序列读长较短，Illumina平台为250-300bp，454平台也只有500bp左右;由于建库中利用了PCR富集序列，因此有一些含量较少的序列可能无法被大量扩增，造成一些信息的丢失，...

对于二代测序的概念是什么？ 第二代测序(Next-generationsequencing，NGS)又称为高通量测序(High-throughputsequencing)，是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们都知道一代测序为合成终止测序，而二代测序开创性的引入了可逆终止末端，从而实现边合成边测序(Sequenci...

二代测序应用于蛋白组测序的常见方式①？ 基于转录组测序间接推断蛋白信息 原理：由于蛋白质是由mRNA翻译而来，先利用二代测序技术对转录组（主要是mRNA）进行高通量测序，获得基因转录水平的信息。基于中心法则中mRNA和蛋白质的对应关系，在一定程度上可以推测出相应蛋白质可能的表达情况。例如，通过分析mRNA的表达量高低，预估...

二代测序技术的一些***研究进展③ 技术优化与创新领域 测序准确性提高：通过改进测序试剂、优化测序反应条件以及开发更先进的数据分析算法，二代测序技术的准确性不断提升，能够更可靠地检测到低频变异和复杂结构变异等。 成本进一步降低：随着技术的不断成熟和市场竞争的加剧，二代测序的成本持续下降，使得更多的研究机构和临床实验室...

什么样本可以做二代测序？③ 细胞样本 培养细胞：包括各种原代培养细胞和细胞系。在基础医学研究中，对培养的细胞进行测序可以了解细胞的基因特征和功能变化。例如，在研究细胞信号转导通路时，对经过特定刺激处理的培养细胞进行转录组测序，以分析基因表达的上调或下调情况。 脱落细胞：如痰液中的脱落细胞、尿液中的脱落细胞等。这些细胞...

二代测序用于蛋白组测序的发展前景？ 多组学整合更紧密：未来二代测序与蛋白组测序会和其他组学技术（如代谢组学、表观基因组学等）进一步深度整合，从多个层面***地解析生命活动分子机制，例如在疾病研究中，综合分析基因转录、蛋白质表达及代谢产物变化等，为疾病的早期诊断、精细***提供更完善的依据。 技术优化提升准确性：一方面，二代...

二代测序技术（NGS） 原理：通过构建DNA文库，在测序平台上对文库中的大量DNA片段进行大规模并行测序，能够同时获得数以百万计的DNA序列信息。 准确性方面： 全基因组检测准确性高：在全基因组测序或者外显子组测序中，能够***地检测基因序列的变化，包括单核苷酸变异（SNV）、插入/缺失（Indel）、拷贝数变异（C...

二代测序在代谢组的发展趋势 深度整合多组学：未来会更加紧密地把二代测序相关的多组学（转录组、表观基因组等）与代谢组学进行整合，构建更为***的生物系统模型，不仅可以更好地阐释复杂生命现象和疾病发***展机制，还能助力药物研发、精细农业等应用领域的发展。 技术协同优化：持续改进二代测序技术和代谢组分析技术，提高各自的灵敏度、...

二代测序——微生物基因组应用领域 工业领域 微生物菌株改良：在发酵工业中，通过对工业微生物（如酵母菌、乳酸菌等）基因组测序，找到与发酵性能相关的基因。例如，通过基因编辑技术改造酿酒酵母基因组中与酒精发酵效率相关的基因，提高酒精产量。同时，也可以通过比较不同优良菌株的基因组，挖掘新的优良基因用于菌株改良。 生物制药：对...

微生物基因组——数据组装后的分析步骤 基因预测：利用软件如Prokka等进行基因预测。这些软件会根据微生物基因组的序列特征，识别出可能的基因区域。例如，通过寻找开放阅读框（ORF）来确定基因的位置和范围。对于细菌基因组，由于其基因结构相对简单，基因预测的准确性相对较高。在预测过程中，软件会考虑密码子偏好性等因素，这是不同微生物在...

①二代测序一般多久出结果？ 二代测序（Next-GenerationSequencing，NGS）出结果的时间会受到多种因素的影响，一般在数天到数周不等。 1、样本类型和质量 不同的样本类型处理时间不同。例如，血液样本相对容易处理，提取DNA的过程比较常规。如果是组织样本，可能需要先进行样本的解离等复杂操作。如果样本...