①二代测序一般多久出结果? 二代测序(Next-GenerationSequencing,NGS)出结果的时间会受到多种因素的影响,一般在数天到数周不等。 1、样本类型和质量 不同的样本类型处理时间不同。例如,血液样本相对容易处理,提取DNA的过程比较常规。如果是组织样本,可能需要先进行样本的解离等复杂操作。如果样本...
查看详细 >>什么样本可以做二代测序?③ 细胞样本 培养细胞:包括各种原代培养细胞和细胞系。在基础医学研究中,对培养的细胞进行测序可以了解细胞的基因特征和功能变化。例如,在研究细胞信号转导通路时,对经过特定刺激处理的培养细胞进行转录组测序,以分析基因表达的上调或下调情况。 脱落细胞:如痰液中的脱落细胞、尿液中的脱落细胞等。这些细胞...
查看详细 >>二代测序——转录组测序的背景和基本原理 1、背景:在基因表达过程中,DNA 转录为 RNA,转录后的 RNA 会经过一系列加工,包括剪接等过程形成成熟的 mRNA,然后进行翻译产生蛋白质。转录组测序可以让我们在全基因组范围内研究基因的表达情况,相比于传统的基因表达研究方法(如芯片技术),它具有更高的分辨率和更广的检测范围。 ...
查看详细 >>二代测序技术在不同人群中的准确性有何差异② 遗传病患者及携带者 优势:在常见单基因遗传病如囊性纤维化、镰状细胞贫血等的检测中,二代测序技术准确性高,能够快速、准确地找到致病基因,对于有家族遗传病史的人群,可有效确定是否携带致病基因,评估生育患病后代的风险。 局限性:对于罕见遗传病,由于基因突变的多样性和复杂性,可能存...
查看详细 >>一代、二代、三代测序的区别分别是什么? 一代测序是上世纪70年代由Sanger和Coulson开创的DNA双脱氧链终止法测序,也称为Sanger测序。 二代测序技术(NGS)是为了改进一代测序通量过低的问题而出现的,能够同时对上百万甚至数十亿个DNA分子进行测序实现了大规模、高通量测序的目标。 三代测序主要有两种技术...
查看详细 >>二代测序技术的一些***研究进展① 疾病诊断与***领域 :消化系统**标志物检测:2024 年的**共识指出,二代测序(NGS)技术可同时检测消化系统**中的多种标志物,如错配修复基因变异、微卫星不稳定性(MSI)状态、**突变负荷(TMB)等,为**的精细***提供了更***、准确的信息。例如,MSI-H 的实体瘤患者可使用...
查看详细 >>二代测序——RNA甲基化的概念、作用和检测方法 RNA 甲基化概念及位置:RNA 甲基化是在 RNA 分子上添加甲基基团,其中 N6 - 甲基腺苷(m6A)是最常见的一种 RNA 甲基化修饰形式,它主要发生在 mRNA(信使 RNA)的腺嘌呤(A)残基上。 作用 1、影响 RNA 的稳定性:m6A 修饰可以影响 mR...
查看详细 >>二代测序的建库步骤⑤ 五、文库富集(可选步骤) PCR富集:对于一些起始样本量较少或者连接效率较低的情况,可能需要进行PCR富集。利用与接头序列互补的引物进行PCR扩增,增加文库中目标DNA片段的数量。在PCR反应中,需要注意引物的设计要与接头序列准确匹配,并且要优化PCR循环数,避免过度扩增导致文库多样性降低或引入PCR...
查看详细 >>二代测序技术在不同人群中的准确性有何差异② 遗传病患者及携带者 优势:在常见单基因遗传病如囊性纤维化、镰状细胞贫血等的检测中,二代测序技术准确性高,能够快速、准确地找到致病基因,对于有家族遗传病史的人群,可有效确定是否携带致病基因,评估生育患病后代的风险。 局限性:对于罕见遗传病,由于基因突变的多样性和复杂性,可能存...
查看详细 >>二代测序技术的一些***研究进展② 植物基因组学研究领域 : 花生四倍体野生种基因组测序:河南农业大学殷冬梅教授团队和上海交通大学韦朝春教授团队联合发布了花生四倍体野生种近乎完整基因组 amon2.0 版本。该研究结合 ONT 超长读段、二代测序和 Hi-C 等多种测序技术,使基因组的连续性、完整性和准确性都得到了显著提高...
查看详细 >>对于二代测序的概念是什么? 第二代测序(Next-generationsequencing,NGS)又称为高通量测序(High-throughputsequencing),是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们都知道一代测序为合成终止测序,而二代测序开创性的引入了可逆终止末端,从而实现边合成边测序(Sequenci...
查看详细 >>二代测序不同应用场景下的速度有多快? 病原微生物检测:一般来说,二代测序用于检测病原微生物时,能够在几个小时到一天左右出结果。比如在快速检测血液中的病原微生物时,通常可以在几个小时内获得检测结果,相比传统的血液培养方法,时间大幅缩短,传统血液培养一般需要几天到一周的时间 。 全基因组测序:如果是对人类全基因组进行测序,以目...
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