SE400系列支持线性梯度凝胶的制备，适用于需要分离宽分子量范围样品的应用。用户可使用Hoefer SG系列梯度混合仪，通过蠕动泵将低浓度和高浓度丙烯酰胺溶液按比例混合，从凝胶三明治底部灌入。梯度凝胶可在同一块胶上同时分离大分子和小分子蛋白，避免因凝胶浓度选择不当导致部分样品无法有效分离。说明书中提供了10%-20%梯度凝胶的配方示例，并建议在高浓度溶液中添加蔗糖或甘油以改善分层效果。梯度凝胶对灌胶技术要求较高，但SE400的制胶支架设计为这一操作提供了稳定支撑。Hoefer SE640垂直电泳仪适合进行快速样品纯度筛选实验。恒压设置垂直电泳仪好处
灌制聚丙烯酰胺凝胶时，正确的聚合和覆盖层技术是关键。说明书中建议在灌胶后，用薄层水饱和正丁醇、水或稀释凝胶缓冲液覆盖凝胶表面，防止单体溶液接触氧气导致聚合不完全。覆盖层应使用玻璃注射器配合22号针头，沿垫条一侧缓慢加入，让液体自然流平。聚合至少需1小时。对于浓缩胶，应在分离胶聚合后倒掉覆盖层，用蒸馏水冲洗顶部数次，吸干残留液体后立即灌制浓缩胶，确保两层凝胶之间无缝接触。这些操作细节对于获得平整的凝胶表面和清晰的条带至关重要。恒压设置垂直电泳仪好处Hoefer SE600垂直电泳仪可使用水或50%乙二醇作为冷却液。
Hoefer SE600系列配备Wonder Wedge柔性塑料工具，用于安全分离电泳后的玻璃板。该工具可插入玻璃板之间，轻轻撬动使两片玻璃分离，避免用力过猛导致玻璃板碎裂或凝胶损坏。Wonder Wedge也可用于灌胶前检查垫条和样品梳的厚度，或推动垫条使其紧贴制胶支架底部导向脚。使用柔性塑料工具替代金属工具，降低了玻璃板边缘碎裂的风险，延长了耗材使用寿命。对于需要回收凝胶或进行转印的实验，Wonder Wedge能够在不损伤凝胶的情况下完成拆板操作，提高实验成功率。
对于已经聚合好的垂直凝胶，在开始电泳前对点样孔进行预处理是保证上样质量和电泳效果的重要步骤。如果使用自灌胶，首先应小心地将梳子从已聚合的凝胶中垂直向上拔出，避免左右晃动导致点样孔壁撕裂或变形。梳子拔出后，点样孔内可能残留有未聚合的丙烯酰胺单体、聚合反应产生的碎片或覆盖液的残留物，这些杂质如果不加清理，会占据点样孔的有效容积，影响样品加入量，并可能导致条带变形或出现“鬼峰”。正确的处理方法是使用微量移液器吸取少量电泳缓冲液，将吸头伸入每个点样孔底部，缓慢注入缓冲液，利用液流冲洗出孔内残留物，然后将冲洗液吸出。这一过程重复2-3次，直至点样孔内清澈无可见颗粒物。对于预制胶，虽然生产过程中已对点样孔进行过处理，但在运输和储存过程中仍可能因干燥或挤压而变形，使用前也应检查点样孔是否平整、无破损，并用缓冲液快速冲洗以去除可能存在的保护剂残留。对于点样孔底部出现气泡的情况，可用细针头将气泡挑破。对于某些特殊的预制胶，点样孔底部可能预制有隔离层，上样时需避免将针头插入过深刺破隔离层。规范的点样孔预处理操作，能够确保每个泳道获得一致的上样条件，是垂直电泳仪获得平直、清晰条带的重要保障。Hoefer垂直电泳仪在SDS-PAGE中，推荐使用恒流模式保证条带平直。
Hoefer SE400系列垂直电泳仪的电泳运行时间取决于凝胶长度、厚度、电流设置和冷却条件。在25 mA/胶、无冷却条件下，SE400（16 cm凝胶）约需5小时，SE410（24 cm凝胶）约需8小时。用户可通过追踪染料的位置判断运行进度。说明书建议在电泳开始5分钟后检查一次，确认样品已正常进入凝胶；1小时后再次检查，评估迁移速率。运行过程中需注意缓冲液液位，确保上电极始终浸没在缓冲液中。若缓冲液因泄漏或蒸发减少，需及时补充。严禁在未监测的情况下连续运行超过1小时。Hoefer垂直电泳仪采用颜色编码电源线，红正黑负防止极性接反。恒压设置垂直电泳仪好处
Hoefer SE600垂直电泳仪在非变性电泳中可保留蛋白天然活性。恒压设置垂直电泳仪好处
Hoefer SE600系列支持三种凝胶厚度：0.75毫米、1.0毫米和1.5毫米。不同厚度的凝胶通过选择相应厚度的垫条实现。垫条宽度有1厘米和2厘米两种规格，长度与玻璃板匹配（Hoefer SE600用16厘米，SE660用24厘米，SE640用8厘米）。较薄的凝胶（0.75 mm）聚合更快、所需样品量更少，适用于快速筛选或样品量有限的情况；较厚的凝胶（1.5 mm）可承载更多样品，适用于需要高灵敏度的检测方法，如考马斯亮蓝染色或后续的蛋白质回收。用户可根据样品浓度、检测灵敏度和实验目的选择合适的凝胶厚度，灵活平衡上样量与分辨率。垫条厚度选择直接影响凝胶孔体积，用户可参考说明书中的孔体积表格进行精确上样量计算。恒压设置垂直电泳仪好处
