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噬菌体展示的Fab也可用于开发针对病原体的治疗性抗体。针对病毒的特异性Fab的筛选主要针对病毒复制过程中的关键蛋白，抑制病毒对机体的入侵从而达到治疗目的。近些年合成Fab噬菌体库针对多个靶标已成功筛选出了多种潜在治疗性分子，如针对人类免疫缺陷病毒包膜蛋白gp41的Fab3674抗体，SARS-CoV-2受体结构域的阻断抗体rRBD-15以及乙肝病毒L蛋白的preS1基序分子的1A8单抗等。这说明噬菌体展示技术不仅能帮助确定病毒靶点，还对治疗性的药物的开发具有极其重要的意义。
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