堀越氏芽孢杆菌(Bacillus horikoshii)是20世纪90年代由日本科学家堀越等从碱性温泉沉积物中分离出的嗜碱菌,也是国际公认的模式菌株(ATCC 700161)[ ^82^ ][ ^84^ ]。菌体杆状、革兰氏阳性,可形成椭圆芽孢,更适pH 8.5–9.5、温度30–37 ℃,在Na₂CO₃浓度50 g L⁻¹的极端环境中仍能正常代谢,被称为“天然碱性细胞工厂”。一、耐碱机制基因组编码多拷贝Na⁺/H⁺逆向转运蛋白(mnh、nhaC)和碳酸酐酶,可将胞内多余Na⁺排出,并将CO₃²⁻转化为HCO₃⁻,维持胞内pH稳态;细胞壁肽聚糖含高比例二氨基庚二酸,增强膜稳定性,为高温高碱酶的高效表达提供平台。二、工业酶潜力其耐碱淀粉酶、普鲁兰酶更适pH 9–10,90 ℃半衰期>2 h,已用于淀粉糖化“一步法”,可省略传统工艺中的中和环节,节能15 %;耐碱蛋白酶在洗涤剂中可去除血渍、奶渍,低温活性优于市场同类酶20 %。三、农业与环境应用菌株P1具备“溶磷-钝化重金属”双重功能:在pH 9、Cd²⁺ 50 mg kg⁻¹条件下,仍可将难溶磷酸钙转化为磷277 mg kg⁻¹,同时胞外多糖吸附Cd²⁺,使水稻籽粒镉含量下降35 %,产量提高18 %。
栗褐芽孢杆菌(Bacillus badius)是芽孢杆菌属的“暗色骑士”。菌落呈独特的栗褐色、边缘不规则,革兰氏阳性大杆菌,具周生鞭毛,可形成椭圆芽孢;更适温度30–37 ℃,pH 6.5–8.5,广分布于森林腐叶、草炭和动物肠道中。一、降解菌株产胞外酚氧化酶、漆酶和半纤维素酶,能把落叶、锯末中的木质-酚类物质分解成腐殖酸,7 d内稻草失重率35 %,腐殖酸含量提高1.8倍,为有机肥“褐化”提供天然菌种。二、防病促生栗褐芽孢杆菌分泌badius脂肽,对番茄青枯、辣椒疫霉抑菌带宽24 mm;同时产IAA 18 mg·L⁻¹,使玉米根长增28 %,吸磷量提棚试验亩施200 g菌粉,黄瓜枯萎病指降40 %,产量增12 %。三、工业酶潜力其漆酶更适pH 5、50 ℃,对染料活性黑KN-B脱色率3 h达85 %,已用于印染废水预处理;耐碱木聚糖酶在pH 9、55 ℃仍保持80 %活性,可助纸浆漂白减少氯用量30 %。四、土壤修复菌体胞外多糖能吸附Cd²⁺、Pb²⁺,吸附量分别达45 mg g⁻¹与30 mg g⁻¹;与生物炭混施,矿区污染土壤有效态镉下降50 %,蔬菜可食部镉低于国标。卷枝毛霉拉斯坦变种新疆糖单孢菌在液体培养时通常不形成菌醭,营养细胞多为双倍体,也有多倍体。有性生殖时产生子囊孢子 。

赫氏埃希氏菌是深海热液口的“化学魔术师”,能在摄氏百度、千倍大气压的暗夜里,把硫化氢当早餐,把二氧化碳当点心来款待。它用氢硫还氧酶把剧毒硫化氢拆成电子与质子,驱动ATP合酶高速旋转,合成能量,再借逆三羧酸循环把无机碳织成有机糖,无需阳光,也能养活整片“黑烟囱”丛林。科学家搭乘深潜器采集菌体,发现其细胞膜含特殊醚键脂质,像给自身裹上耐高温的陶瓷瓦,蛋白质内部也布满离子键,仿佛微型钢铁骨架,才让它在沸水中依旧柔韧。实验室里,研究团队把它的固碳基因簇移植到工业大肠杆菌,使后者能在废气流里自养生长,产出的聚羟基脂肪酸酯可制可降解塑料,为碳中和提供新思路。小小赫氏埃希氏菌,用肉眼看不见的臂膀,托住地球深部与未来的绿色循环。
环状芽孢杆菌(Bacillus circulans)是芽孢杆菌属的“多面手”,因菌落边缘呈规则的环状扩散而得名。菌体短杆、革兰氏阳性,具周生鞭毛,可形成椭圆芽孢,更适温度30–37 ℃,pH 6–9,广分布于土壤、淡水与海洋沉积物中。一、细胞壁“”该菌能产生几丁质酶、β-1,3-葡聚糖酶和纤维素酶,可分解菌细胞壁、植物残体和甲壳类废料,为碳循环打开“绿色通道”。实验室条件下,其几丁质酶粗酶液4 h内可降解蟹壳粉60 %,为甲壳素提取提供环保方案。二、生物防治与促生菌株BC-01分泌circulin A/B环肽,对立枯丝核菌、番茄青枯拉尔氏菌抑菌带宽达25 mm;同时产IAA 20 mg·L⁻¹,使玉米根长增30 %,吸磷量提22 %。大棚试验每亩滴灌200 g菌粉,黄瓜枯萎病指下降40 %,产量增12 %。三、工业酶宝库环状芽孢杆菌的碱性蛋白酶在pH 10、50 ℃下活性比较高,已用于无磷洗涤剂,血渍去污力提升30 %;耐热β-淀粉酶可将淀粉转化为麦芽糖,糖浆得率提高15 %,为食品与发酵工业提供绿色催化剂。四、医药与环保该菌能合成胞外多糖,具有良好的乳化和增稠性能,已用于面包保鲜,货架期延长3天。牙龈蛋白酶(Gingipains)是牙龈卟啉单胞菌在细胞内合成并分泌到细胞外的一种胰蛋白酶样半胱氨酸蛋白酶。

史氏芽孢杆菌(Bacillus smithii)是芽孢杆菌属中嗜热分支的,标准菌株 JCM 9076 更初从高温堆肥中分离,能在 55 ℃、pH 6.5 条件下旺盛生长,芽孢可耐 100 ℃沸水 2 h,是验证高压灭菌效果的指示菌之一。其细胞壁含特殊脂肪酸,膜脂熔点高,配合小分子热休克蛋白,使核糖体和 DNA 在高温下仍保持构象稳定,赋予菌体“耐热盾牌”。2024 年,中国团队从镉污染稻田筛选到解磷菌株 M2(保藏号 CCTCC M2024167),鉴定为 Bacillus smithii。该菌兼具三重抗逆:耐盐 6 %、耐镉 50 mg·L⁻¹,并能在 pH 4.5–9.0 范围内正常分泌有机酸,将难溶磷酸钙转化为磷,盆栽试验中使玉米根际有效磷提高 42 %,籽粒镉含量下降 35 %,实现“增磷减镉”同步完成。在酶制剂方向,史氏芽孢杆菌是“高温酶工厂”。其胞外碱性淀粉酶更适温度 70 ℃,在洗涤剂、烘焙和酒精浓醪发酵中可省去降温环节,节能 15 %;耐有机溶剂蛋白酶可在 60 ℃、30 % 乙醇环境中保持 80 % 活性,为生物炼制提供新型催化剂。农业应用上,M2 菌株可与秸秆堆肥复配,使堆体温度 24 h 升至 65 ℃,纤维素降解率提高 30 %,堆肥周期缩短 7 d;作为功能性菌剂,每亩随基肥施入 200 g 菌粉,冬小麦越冬前磷吸收量提高 18 %,分蘖数增加 1.2 个,对后期倒伏有明显缓解作用。粪肠球菌作为益生菌具有多种功能特性,如耐胃酸、胆汁,高温环境稳定,定植力强,起到占位保护作用。火鸡沙门氏菌
在科研领域,奇异水螺菌常被用作研究微生物生态、基因调控和代谢途径的模型生物。水生屈曲杆菌
异常嗜冷芽孢杆菌(Bacillus psychrodurans)是芽孢杆菌属的“极地移民”。标准菌株能在-2 ℃缓慢增殖,更适生长温度只15 ℃,比较高不超过30 ℃;芽孢可耐受-20 ℃反复冻融,是研究低温适应的模式菌之一。其细胞膜富含短链与支链脂肪酸,冷休克蛋白Csp持续表达,使核糖体和RNA在冰水中仍保持活性,为“零度工厂”提供分子基础。在农业端,菌株L-4可分泌IAA 18 mg·L⁻¹并溶出有机磷2.3 mg·L⁻¹,4 ℃下仍使冬小麦根长增加25 %,返青期提前5天,分蘖数提高一成,相当于给作物披上“生物羽绒服”。工业方面,它的耐冷蛋白酶已在洗涤剂中试用,10 ℃洗衣去污力提升30 %,节能20 %;低温淀粉酶可将糖化温度由60 ℃降至35 ℃,为寒区酒精发酵节约大量蒸汽。环境修复更彰显其“冰雪技能”。菌株ANT-1在-5 ℃、10 %盐度下60天降解柴油60 %,为极地溢油、寒区输油管线泄漏提供原位生物修复方案;与冰藻共培养时,还能吸附Cd²⁺、Pb²⁺,吸附量分别达50 mg·g⁻¹和35 mg·g⁻¹,让重金属在冰层中被“冻结”并随菌体沉降。未来,借助合成生物学,把异常嗜冷芽孢杆菌的“冷酶+冷激”模块植入生产底盘,有望实现“零加热”生物制造,让微生物在冰水里也能为人类催化高值反应。水生屈曲杆菌