短梗霉属

蔬菜芽孢杆菌（Bacillus oleronius）是芽孢杆菌属里“更懂蔬菜”的专性住客。更初从腐烂生菜叶脉中分离，菌体纤细、革兰氏阳性，具周生鞭毛，能形成椭圆芽孢，耐干燥、耐低氧，可在pH 5–9、温度15–40℃范围内生长，更适与蔬菜根际环境高度重叠，故得名“oleronius”（拉丁语“菜园的”）。它的首要武器是“蔬菜定制”抑菌谱。菌株QSI-1可分泌酰基高丝氨酸内酯酶（AHL-lactonase），切断软腐欧文氏菌、胡萝卜果胶杆菌的群体感应信号，使病原菌无法启动果胶酶基因，白菜软腐病斑减少70%；同时产生表面活性素与fengycin，对番茄叶霉、辣椒疫霉抑菌带宽达28 mm，且能形成生物膜覆盖伤口，阻止二次侵染。第二技能是“温和促生”。蔬菜芽孢杆菌合成IAA 20 mg/L，并溶出有机磷3.2 mg/L，诱导生菜、菠菜根系增30%，叶绿素提高1.5个SPAD单位，硝酸盐含量下降12%，明显提升蔬菜品质与安全。工厂化应用上，研究者将菌株QSI-1与褐藻寡糖复配，制成活菌数10⁸ CFU/mL的“蔬菜保鲜微乳”，采后喷施可抑制软腐、灰霉，使生菜货架期由7 d延至14 d，失重率<5%，已在上海崇明有机农场示范推广。解硫胺素类芽孢杆菌还具有生物转化能力，能够将一些复杂的有机化合物转化为更有价值的产物。短梗霉属

吉氏芽孢杆菌（Bacillus gibsonii）是芽孢杆菌属中“耐热兼耐碱”的新锐成员，2004年由德国学者从堆肥超温区分离，命名源自菌种保藏家 Gibson 的姓氏。菌株呈杆状、革兰氏阳性，可形成椭圆芽孢，只适生长温度 50–55 ℃，pH 8.5–9.5，能在 10 % Na₂CO₃ 和 1 % 过氧化氢条件下存活，被视作“碱性酶工厂”的理想候选。一、耐热耐碱机制基因组编码多拷贝 Na⁺/H⁺ 逆向转运蛋白（nhaA、nhaC）与碳酸酐酶，可将胞内多余 Na⁺ 排出并维持 pH 稳态；芽孢富含钙-吡啶二羧酸复合物，赋予其 100 ℃、30 min 的耐热能力，为高温高碱工业环境提供稳定催化剂。二、工业酶宝库其耐碱普鲁兰酶只适 pH 9、70 ℃，可高效切割 α-1,6 糖苷键，用于淀粉糖化“一步法”，节省中和酸用量 20 %；耐碱木聚糖酶在 pH 10、65 ℃仍保持 85 % 活性，已用于纸浆漂白，减少氯用量 30 %，降低 AOX 排放；碱性蛋白酶则在 40 ℃、pH 11 条件下对血渍、奶渍去污力提升 35 %，为无磷洗涤剂增添绿色助剂。三、农业与环境菌株 TP-1 可产 IAA 12 mg·L⁻¹ 并溶磷 2.8 mg·L⁻¹，使玉米根系增 25 %，吸磷量提 18 %；与秸秆复配堆肥，24 h 堆温升至 65 ℃，纤维素降解率提高 28 %，堆肥周期缩短 6 d，杀灭病原菌和杂草种子效果明显。格氏勒米诺菌耐热芽孢芽孢杆菌是微生物世界的“高温铁人”。

YPG培养基（Yeast Extract-Peptone-Glucose Medium）是酵母提取物-蛋白胨-葡萄糖培养基的简称，堪称微生物实验室的“快餐”。配方极简：酵母粉5 g、蛋白胨10 g、葡萄糖20 g，补水至1 L，pH 6.2±0.2，无需调节即可满足大多数菌、酵母及部分细菌的快速增殖需求。酵母粉提供B族维生素和微量元素，蛋白胨供给多肽与氨基酸，葡萄糖以高碳浓度启动酵母发酵型代谢，短短12 h就能让酿酒酵母OD₆₀₀冲破1.0，是发酵工程与分子生物学过夜预培养的优先。若用于丝状菌，只需降低葡萄糖至10 g，并加入微量元素液，28 ℃静置2天，孢子产量可比PDA提高30%。YPG的另一优势是“可盐可甜”：补加15%甘油即成YPG/甘油，用于酵母感受态制备；添加2%琼脂便是YPG平板，蓝白斑筛选、转化子计数两不误。实验室里还流行“富氧版”——把葡萄糖提前115 ℃单独灭菌，避免美拉德反应，培养液颜色浅，下游HPLC检测有机酸无干扰。质量控制也轻松：高压后若颜色发黄，说明葡萄糖与氨基酸高温反应，可改用过滤除菌；室温保存1周仍澄清，即可继续使用。凭借组分明确、成本低廉、配制快速，YPG培养基已从传统酿酒实验室走向合成生物学、代谢工程与益生菌高密度发酵，成为微生物学家手中“养菌如泡茶”的经典底牌。

解糖肠球菌（Enterococcus saccharolyticus）是一种革兰阳性、兼性厌氧的球菌，更早从英国稻草垫料中分离，模式菌株ATCC 43076被广用于API及VITEK®系统的质量控制。该菌因能发酵多种糖类产酸，故得名“解糖”，在分类学上与粪肠球菌、屎肠球菌并列，却极少携带典型毒力基因，安全性较高。近年研究发现，解糖肠球菌具有突出的益生潜力：它可在pH 2.5的胃酸和0.3%胆盐中保持90%存活，并分泌乳酸、乙酸等短链脂肪酸，迅速降低肠道pH，抑制沙门氏菌、大肠杆菌等致病菌的定植。体外试验还显示，该菌能黏附于Caco-2细胞单层，上调紧密连接蛋白ZO-1与Occludin的表达，增强肠屏障功能，减轻脂多糖诱导的炎症反应。在动物应用中，日粮添加10^7 CFU/g解糖肠球菌可显著提高断奶仔猪平均日增重8.7%，降低料重比6.3%，并减少腹泻率一半；其代谢产物还能促进双歧杆菌、乳酸菌等有益菌增殖，使结肠丁酸浓度升高30%，改善绒毛高度与隐窝深度比。此外，该菌对万古霉素敏感，不含vanA/vanB耐药操纵子，降低了基因横向转移风险。综上，解糖肠球菌凭借耐酸耐胆盐、产酸抑菌、增强屏障及促生长等多重功能，被视为替代抗生物质的潜力菌株，未来在婴幼儿食品、畜禽养殖及微生态制剂领域具有广阔前景。格雷厄姆氏根瘤菌是豆科家族里更“挑剔”的房客，却只认花生这一位房东。

史氏芽孢杆菌（Bacillus smithii）是芽孢杆菌属中嗜热分支的，标准菌株 JCM 9076 更初从高温堆肥中分离，能在 55 ℃、pH 6.5 条件下旺盛生长，芽孢可耐 100 ℃沸水 2 h，是验证高压灭菌效果的指示菌之一。其细胞壁含特殊脂肪酸，膜脂熔点高，配合小分子热休克蛋白，使核糖体和 DNA 在高温下仍保持构象稳定，赋予菌体“耐热盾牌”。2024 年，中国团队从镉污染稻田筛选到解磷菌株 M2（保藏号 CCTCC M2024167），鉴定为 Bacillus smithii。该菌兼具三重抗逆：耐盐 6 %、耐镉 50 mg·L⁻¹，并能在 pH 4.5–9.0 范围内正常分泌有机酸，将难溶磷酸钙转化为磷，盆栽试验中使玉米根际有效磷提高 42 %，籽粒镉含量下降 35 %，实现“增磷减镉”同步完成。在酶制剂方向，史氏芽孢杆菌是“高温酶工厂”。其胞外碱性淀粉酶更适温度 70 ℃，在洗涤剂、烘焙和酒精浓醪发酵中可省去降温环节，节能 15 %；耐有机溶剂蛋白酶可在 60 ℃、30 % 乙醇环境中保持 80 % 活性，为生物炼制提供新型催化剂。农业应用上，M2 菌株可与秸秆堆肥复配，使堆体温度 24 h 升至 65 ℃，纤维素降解率提高 30 %，堆肥周期缩短 7 d；作为功能性菌剂，每亩随基肥施入 200 g 菌粉，冬小麦越冬前磷吸收量提高 18 %，分蘖数增加 1.2 个，对后期倒伏有明显缓解作用。土地鞘氨醇盒菌（Sphingopyxis terrae）是一种具有重要环境修复潜力的微生物。锗栓孔菌淡黄褐栓菌

竹刀鱼希瓦氏菌具有还原三价铁、液化明胶、Tween 40和Tween 80的能力，并且能够产生H2S。短梗霉属

谲诈明串珠菌（Leuconostoc fallax）是明串珠菌属中“貌善心狠”的。菌落乳白、表面光滑，细胞球形成对，发酵葡萄糖产酸产气，看似温顺，却能在泡菜前期迅速增殖，借“糖衣”胞外多糖包裹自己，欺骗宿主免疫系统，故得“谲诈”之名。基因组分析揭示，它携带一套罕见的寡肽转运与组氨酸激酶双组分系统，可感知渗透压与酸度变化，一旦环境pH降至4.0以下，便启动“式”产酸爆发，短时间内释放大量乳酸与乙酸，排挤同坛的乳酸菌盟友，独占发酵主导权。更“狡黠”的是，该菌能分泌一种细菌素Fallaxin，对李斯特菌、金黄色葡萄球菌等革兰氏阳性食源性致病菌具有窄谱杀伤，却对自身及泡菜关键菌株无害，借此在微生态博弈中“借刀杀人”。然而，其高活性胞外多糖合成酶在低温（4℃）仍持续表达，导致泡菜后熟期口感发黏，被食品工程师视为“品质陷阱”。研究尝试通过CRISPR敲除其负调控基因rex，使谲诈明串珠菌在pH 3.8即自动休眠，既保留抑菌特长，又避免过度产黏，为精细控制传统发酵蔬菜的微生态提供了一把“基因开关”。短梗霉属