NA基因扩增子测序及分析,研究菌群分布。参考文献2:·样本类型:***种子。·样本粉碎:每管20粒种子,电动组织研磨器配合研磨杵,研磨5min。·样本DNA提取:FastDNA Spin Kit for Soil提取。·下游实验:细菌16S rDNA基因扩增子测序及分析,研究菌群分布。 相关文献:1.Campisano A ,Antonielli L , Pancher M , et al. Bacterial Endophytic Communities in theGrapevine Depend on Pest Management【J】. Plos One, 2014, 9.2.Chen X , Krug L ,Yang H , et a益启生物提供专业的土壤DNA提取。青浦区土壤DNA提取土壤DNA提取代理价
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调节样本的含水量等因素来优化裂解条件·裂解不充分:增加物理破碎的时间和次数。·检查洗涤液中是否加入乙醇。·洗脱不充分:建议二次洗脱增加产量或提高洗脱体积。问题3:提取的DNA无法扩增怎么办?解决思路:· 检测DNA的浓度:过量的DNA模板也会抑制PCR反应。·样本DNA稀释之后可以扩增:样本中的腐殖酸等抑制物含量高。·确定PCR反应条件是否已优化:退火温度,时间,引物等等。·非特异条带:洗脱液中目的DNA的丰度可能比较低全网优惠的土壤DNA提取在哪里购买?土壤DNA土壤DNA提取报价
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。如果样品中的目的微生物含有比较厚的细胞壁,可能需要额外的破碎裂解。问题4:洗脱的DNA颜色为黄色或棕色怎么办?解决思路:·腐殖酸含量高【1】在洗涤步骤之前,可先用4.5M-5.5M的异硫氰酸胍溶液洗涤1-2次。【2】减少样本用量。问题5:A260/A280比值偏低怎么办?解决思路:·蛋白去除不干净:增加蛋白沉淀离心的次数。·洗涤不干净:增加洗涤次数。问题6:A260/A280比值高怎么办?解决思路:·RNA含量高,可在洗脱之后的溶液中加青浦区土壤DNA提取土壤DNA提取代理价
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