尽管FMT的临床疗效突出,但在2013年之前一直被认为是“民间偏方”。直到2013年初,华盛顿大学Surawicz教授领衔的合作组将FMT写入rCDI诊疗的临床指南,这在FMT医学史上具有里程碑性的意义。同年,《时代》杂志将其评为2013年生物医学的重大突破之一,《科学》同样将其评为生物医学的重大突破之一;2017年菌群移植被美国克利夫兰医学中心评为“年度重大医学创新”。2018年,菌群移植写入由中华医学会消化病学分会炎症性肠病学组撰写的《炎症性肠病诊断与诊疗的共识意见》,提示菌群移植技术在IBD诊疗中具有较好的效果,得到了国内**的肯定;2019年3月份发布的管理条例中认为菌群移植是低风险的一个医疗新技术。
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通过FMT恢复肠道菌群组成和调节菌群失调可能是诊疗各种神经系统疾病的有效方法,但当前的证据依然有限。在Zhan等人进行的一项实验中,小鼠首先接受连续14天的广谱抗*素诊疗。随后,作者将来自衰老加速小鼠易感型8(SAMP8)或抵御衰老老加速小鼠1(SAMR1)小鼠的粪菌移植到伪无菌(pseudo-germ-free)小鼠中,结果他们观察到,接受了来自SAMR1小鼠的伪无菌小鼠的空间学习和记忆能力得到改善,而接受SAMP8小鼠粪菌移植的则没有。Yu等人分别使用了有和无认知功能恶化的糖尿病小鼠,并将无认知功能障碍小鼠的粪菌移植到伪无菌小鼠的肠道中。他们注意到宿主Morris水迷宫性能指数的显着改善,该影响与宿主肠道微生物的β多样性及相对丰度变化有关。浙江自体菌群移植**共识菌群移植--溃疡性结肠炎患者的福音。

北京某军总院使用菌群移植(FMT)对自闭症及炎症性肠病患者进行大量临床研究且疗效明显,如第一阶段的队列研究中FMT诊疗溃疡性结肠炎的临床应答率为90%;重庆陆军军医大学大坪医院为顽固性constipation、艰难梭菌等患者实施FMT,病情得到明显缓解;2017年厦门大学附属中山医院报道了对乙肝大三阳患者实施药物诊疗联合菌群移植,这是国际上利用菌群移植诊疗乙肝的早期报道;另外,西安西京消化病医院、广东药科大学附属好早医院、南昌大学好早附属医院、广州市第一人民医院、中南大学湘雅医院附三医院、贵州医科大学附属早期医院、宁夏医科大学总院等医院也都陆续开展了FMT的临床医疗服务。随着临床有效性及安全性的更多证实,尤其是菌群移植临床体系的进一步完善和规范,菌群移植疗法将会服务于更多患者。
精细化菌群移植的流程,包括供体的筛选,菌群的分离提取(沃本生物有自主知识产群的菌群分离仪,并已完成生产菌群的分离提取,这是菌群移植2.0时代的标志),菌群库的建设,供受体配型(供受体配型是菌群移植3.0时代的标志),然后是移植方式的选择。移植途径的建立是FMT实施的重要环节,狭义的移植途径是指将功能菌群通过某种路径传递入患者肠道内,具体包括上消化道路径与下消化道路径;广义的移植途径是指为了顺利将功能菌群传递入患者肠道、并尽可能使其有效性和安全性比较大化而采取的一系列措施,包括移植前准备、移植路径的建立和围移植期监测与护理。关于儿童菌群移植技术规范的共识。

UC患者菌群移植优先鼻肠管或肠镜行FMT,如病变只于直肠乙状结肠部位也可优先保留灌肠(1B)目前报道的FMT诊疗UC的队列研究中,菌液输注路径包括上消化道途径(鼻胃管、鼻肠管和胃镜等)、下消化道途径(结肠镜、灌肠等)和混合途径(早期结肠镜输注+多次保留灌肠)。其中Meta分析显示,不同的移植途径对UC的临床疗效差异无统计学意义。在已报道的6项随机对照试验(randomizedcontrolledtrial,RCT)研究中,只有1项显示健康供体FMT与自体FMT对UC的缓解差异无统计学意义,该研究干预组在研究开始和3周时分别经鼻十二指肠管一次性注入500ml粪菌液,对照组使用同种方法接受自体移植,其他5项RCT均为经保留灌肠或结合结肠镜重复多次行FMT,但这并不意味着鼻肠管途径效果劣于其他途径,因为诊疗效果受到输注菌液重复次数的影响。菌群移植在肝脏疾病中的应用。河南自闭症使用菌群移植技术及其过程
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菌群移植供体筛选的标准:1.生理上主要依赖科学测量与实验室检测完成(1A)(1)内科外科体格检查均为阴性;(2)年龄18~30周岁,体质指数(bodymassindex,BMI)18.5~23.9kg/m2;(3)血液学检测:血常规、肝肾功能、电解质和C反应蛋白正常,甲乙丙丁戊肝、人类免疫缺陷病毒(humanimmunodeficiencyvirus,HIV)、梅毒、人类疱疹病毒(epstein⁃barrvirus,EB病毒)、巨细胞病毒、线虫、阿米巴等病原检测阴性;(4)粪便检测:粪便常规检查正常,隐血实验阴性,艰难梭菌、弯曲菌、沙门菌、志贺菌、产志贺大肠杆菌及虫卵、囊泡、寄生虫、孢子、诺如病毒、轮状病毒等病原学检测阴性,多重耐药基因[碳青霉烯类耐药的肠杆菌科(CRE),产广谱β⁃内酰胺酶菌(ESBL)和耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌(MRSA)等]检测阴性;(5)血清单基因遗传性疾病阴性;(6)粪便Sars-Cov-2(COVID⁃19)阴性。河南供体菌群移植仪器
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