通过改变参数（见第5.3节）和评估他们对梁色质回收率的影响来优化这些步骤。使用机械力，如杜恩斯匀浆器或坡璃珠改善细脆溶辉。优化裂解步要和避免起泡。 在甲醛中培养时间过长可能掩盖经ChIP抗体识别所需要的表位。如果您使用的是单克隆抗体，此问题可能更加严重。过度交联也可能导致超声处理时复合物难以形成。优化交联步骤∶甲醛的**终液度应为1%;您应确定***的交联时间，然后再继绩进行实验。在研究方案的后续步骤中，交联不足可能引起靶蛋白从DNA解离。
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例如，磷酸特异性抗体可能*与活化的磷酸化蛋白发生反应。如果您的蛋白定位在胞内，则必须对细胞进行裂解。流式细胞实验可能要选择识别细胞表面分子的抗体。如果您的蛋白有三级结构，且掩盖了抗原表位，则必须对样本进行变性，因为有些抗体无法识别自然状态的蛋白。一些抗体*在冷冻或非固定组织中起效，而有些抗体*对经抗原修复后的石蜡切片起效。
目标蛋白的物种来源
比较好选择明确标有目标蛋白种属的抗体。参考抗体说明书或网站信息。 奉贤区鉴定抗体抗体订购上海标签抗体哪家靠谱？
在将进行ChIP咳PCR实验的地点期近，不得打开含有扩增PCR产物约试幢。
确保您使用的抗体是在ChIP中给证过的抗体。关于ChIP抗体约完整选择过程，请参见默克官网表观遗传学。如果您正使用ChIP抗体，请增加抗体的解育时间。 一般1-10uq ChIP抗体是足够的。但是，所需抗体量可能取决于您的靶轮蛋白相对丰度和抗体与靶标的亲和力。 在交联前，单独准备一个平板，用于测定细胞数。重新评价每个反应的细您数。增加您的细晚数，特别是在尝试检测较任丰度的靶蛋白时。
在本节中，将讨论目前仍在应用中的主要免疫技术理论和实验。
免疫学研究时间轴
1900.Ehrlich提出抗体形成理论
1938.Marrack提出抗原-抗体结合假说
1962.Edelman & Porter解析抗体分子结构
1975.Kohler & Milstein开发单克隆抗体产品
1986.采用基因工程生产乙肝疫苗
1900.Landsteiner & Levine使用天然抗血清识别ABO血型
1900.Nuttall, Wasserman &Schutze 采用沉淀素试验区分人乳、牛乳和山羊乳
1900-01.Uhlenhuth 关于鸡蛋蛋白分型的工作，在医学工作中用沉淀素反应进行人血液染色铺平了道路
1942.Coons等发表IHC关键研究。抗体是采用FITC标记的
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IHC 是从根词immuno"（与在操作中所用的抗体有关）和"histo"（意思是"组织"）而得其名称。与之不同，免疫细胞化学（ICC）的根词是"cyto"（意思是"细胞"），是以培养或分离的细胞代替组织进行的。IHC和ICC广泛应用于基础研究，目的是了解生物标记物的分布和定位以及在生物组织或细胞中差异表达的蛋白。
在IHC/ICC中的主要步骤如下∶·样本制备·抗原修复· 抗体染色·抗体检测
成功的IHC实验取决于高质量抗体选择和合遇的实验浓度。每一种抗体都要根据实际的实验情况进行优化。即使是同一反应体系，针对不同的抗体适合的稀释浓度也是不同的。实验者可以以说明书上推荐的稀释倍数作为参考。
SNAPi.d.⑧2.0IHC加速器带来的主要改进·直观的设计，将封闭、洗涤、抗体孵育及标记等步骤结合起来· 不需要使用石蜡笔·抗体可以收集后继续使用
·切片操作时间大幅减少，洗涤步骤耗时大幅减少，可同时操作多达24涨切片
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信号弱
信号高
本底较高
准确度较低（一偶然误差）
计算的教据过高或过任《一系统误差，数据与"标准数据"的偏差）
可能的原因： 实验试剂使用错误实验试剂损坏
所用实验试剂稀释度错误仪器的过滤器选择错误（波长）前育时间过短，温度过低
试剂温度不正确
在较高浓度时，叠氮化钠、燕基乙身或DTT可能干扰过氧化物恃活性。所用实验试剂稀释度错误醇育时间过长，温度过高
洗洛不足洗得污染
试剂或小瓶/试管受到以前实验的污染
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