对于成功的ChIP实验，选择适当的ChIP抗体是**关键的步骤之一。即使是比较高质量的抗体，即在经典的Western blot验证中表现非常好的抗体，也不一定适合ChIP。比较好只考虑使用在ChIP实验中专门验证过的抗体。一般的， ChIP实验之后会用定量PCR（qPCR）来验证某一特定DNA序列是否与靶蛋白有关。研究人员可以采用这种经典方法评估目标蛋白与已知的靶基因之间的相互作用。
ChIP实验可以细分为以下几个主要步骤：
样品制备
蛋白与DNA交联
细胞裂解和染色质片段化
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在保存抗体时请注意以下几点：
为保持比较大反应性，应按照厂家说明书保存试剂（如，当指定保存温度为2-8℃时，应避免将抗体置于室温下）。保存抗体的经验法则是将其置于非无霜冰箱/制冷机内的严格密封容器中，远离组织固定剂和交联试剂。除非加入稳定蛋白，如BSA（1% w/v），否则抗体不得
在工作液中长期保存。避免长期保存稀释的抗体。保存时遇到的主要问题是细菌或***污染。
如果抗体保存在2-8℃超过2-3天，建议进行过滤除菌和/或加入抑菌剂/防腐剂，如0.05%叠氮化钠或0.1%硫柳汞。 静安区Abcam抗体抗体联系人上海买Merck抗体哪家靠谱？
随着药物研发和蛋白研究水平的快速增长，人们希望能在有限的样本中快速获得和分析大量数据用于疾病早期诊断，个性化***及药物开发等多个方面。而采用传统的“单重”蛋白检测法，如ELISA或蛋白免疫印迹分析法，获得这些信息越来越困难、不实际或受成本限制。因为多因子检测法允许在单独一份复杂和非均质样品中检测多重分析物，所以当分析血清、脑脊液、腺体分泌物或其它生理样品时，经证实这种方法是特别有效的。多重蛋白检测的方法常以双抗夹心法为基础，或固定在芯片上作为“平面阵列”或结合于微珠作为“悬浮阵列”。
除非您正在研究组蛋白和组蛋白修饰，否则您应采用X-ChIP方案，以使您的靶蛋白与DNA的连接稳定。增加交联时间。 蛋白G磁珠能结合更大范践的执体，包括小鼠单克境抗体，为达到抗体选择的比较大灵活性，我们推荐使用蛋白A/G混合物（目录号16-663）。检测PCR引物的效果。加入相应的时维物，必要时重新设计引物。
关于ChIP中关键步骤的详细讨论及实验问题解答，请参考默克密理博染色质免疫沉淀指南（ChIP实验指南）。
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在阴性对照（igG或mockIP）样品中本底较高
抗体过量导致抗体与非靶蛋白结合∶
与珠子的非特异性结合∶
染色质的不完金裂解∶
试剂污染∶
"无DNA" PCR反应显示信号
DNA的较低回收率
ChIP抗体无效或较低亲和力：
ChIP抗体不足：
起始样品不足：
细胞不完全溶解和无效裂解：
交联过度：
交联不足：
亲和力较低或珠子质量较差：
PCR引物：
优化抗体的浓度。
加入-个残***步理，以除这些非特异性蛋白或添加珠子的阻断剂。
优化取解过程，以民得介于200-100bp长度的染色质。 上海益启生物的科研抗体销售电话。松江区组蛋白抗体抗体参数
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通过改变参数（见第5.3节）和评估他们对梁色质回收率的影响来优化这些步骤。使用机械力，如杜恩斯匀浆器或坡璃珠改善细脆溶辉。优化裂解步要和避免起泡。 在甲醛中培养时间过长可能掩盖经ChIP抗体识别所需要的表位。如果您使用的是单克隆抗体，此问题可能更加严重。过度交联也可能导致超声处理时复合物难以形成。优化交联步骤∶甲醛的**终液度应为1%;您应确定***的交联时间，然后再继绩进行实验。在研究方案的后续步骤中，交联不足可能引起靶蛋白从DNA解离。
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