eProteinDiscovery系统：一种将无细胞蛋白合成与数字微流控相结合的快速蛋白质原型系统传统的蛋白质表达纯化流程十分依赖人工操作，并且往往需要几周甚至更久。无细胞蛋白表达的兴起可将这一时间缩短至十几个小时，但是仍需要现进行表达载体的制备，体外扩增和高通量蛋白表达然后再进行筛选等多步操作。Nuclera将这些复杂的流程ji he到eProteinDiscovery系统。该系统使用基于数字微流控的智能卡盒、无细胞蛋白质合成和荧光蛋白检测技术，使研究人员更容易大规模获取高质量蛋白质。只要将目标蛋白质的序列输入配套软件，就可以利用预设融合标签定制DNA构建体以优化表达，然后将表达载体装载到机器上，该系统就会通过自动化构建筛选（可同时筛24种构建体x8种无细胞混合物=192种表达条件），在48小时内，根据可溶性、可纯化性和纯化产量数据确定Zui Jia表达条件，然后放大规模并获取蛋白质以供下游应用。该工作流程jin需3步，可生产18kDa~300kDa的蛋白质，还更容易地筛选和获取同源物、直系同源物、突变和异构体。CHO细胞重组蛋白表达是生产抗体的常用技术。高通量蛋白表达的性价比
在无细胞合成生物学的框架下，可编程分子制造引擎的he xin角色可让体外蛋白表达充当。其模块化特性允许研究者将生物系统解构为三个可du li操作的层级：信息层：DNA/mRNA模板作为信息载体，其启动子强度（如T7系统表达量比SP6高3倍）与5'UTR二级结构（ΔG<-50 kJ/mol时翻译效率锐减）可自由优化；执行层：裂解物中的核糖体作为分子机器，通过补充非天然氨基酸（如对叠氮苯丙氨酸）扩展产物化学空间；调控层：添加核糖核酸开关（Riboswitch）或适配体（Aptamer）实现反馈控制，例如当产物积累至阈值浓度时触发终止子发卡结构折叠终止反应。这种分层控制使体外蛋白表达能够驱动人工设计基因回路的构建，例如合成振荡器系统中T7 RNA聚合酶的自抑制表达实现周期为120分钟的蛋白质浓度波动，为构建人工细胞提供可控的时空动态基础。多次跨膜蛋白表达水平体外蛋白表达需使用不含质粒骨架的模板以避免副反应。
提升体外蛋白表达效能的关键技术路径包括：裂解物工程化改造： CRISPR敲除核酸酶/蛋白酶基因增强稳定性，或过表达分子伴侣（如GroEL/ES）改善折叠；能量再生系统强化： 耦合葡萄糖脱氢酶与ATP合成酶模块，实现ATP持续再生；膜蛋白表达突破： 添加脂质纳米盘（Nanodiscs）提供类膜环境，促进跨膜结构域正确折叠；高通量筛选适配： 微流控芯片实现万级反应并行运行，单次筛选规模超越传统细胞方法。这些策略共同推动该技术向 更高效率、更低成本、更广适用性演进。
在中国，无细胞蛋白表达技术（CFPS）的推广面临he xin原料依赖进口的挑战。商业化裂解物、高效能量再生系统等关键试剂仍以Thermo Fisher、Merck等国际品牌为主，国产替代品在活性和稳定性上存在差距，导致成本居高不下。此外，无细胞蛋白表达技术工艺的规模化放大技术尚未成熟，反应体系均一性、产物收率等问题限制了其在GMP生产中的应用。尽管国内科研机构（如中科院、清华大学）在基础研究上取得突破，但产学研转化效率较低，缺乏类似Synthelis的专注无细胞蛋白表达技术的本土企业，难以形成完整的产业链条。随着工程化裂解物与自动化设备的进步，体外蛋白表达技术将继续向更低成本、更高精度进化。
尽管体外蛋白表达在科研领域优势明显，其规模化应用仍面临三重挑战：裂解物制备成本高： 真核裂解物（如兔网织红细胞）的原料获取与标准化生产难度大，单位成本远超微生物发酵；反应体系稳定性不足： 蛋白酶/核酸酶导致的产物降解及底物（如ATP）快速耗竭限制持续合成时间；产物浓度天花板： 当前比较好工艺的蛋白产量约5g/L，较CHO细胞系统（>10g/L）存在差距。解决这些瓶颈需开发 工程化裂解物（如RNase缺陷型菌株）与连续流灌注技术，提升经济可行性自供能体外蛋白表达系统是构建人工细胞的重要路径。多次跨膜蛋白表达量
添加0.5mM PMSF将 体外表达蛋白的降解率从45%压制至<5%。高通量蛋白表达的性价比
无细胞蛋白表达技术（CFPS）虽然具有快速、灵活等优势，但仍存在一些关键缺点。首先，成本较高，商业化裂解物、能量试剂和酶的价格昂贵，小规模实验单次反应成本可达数百元，大规模生产的经济性尚未完全解决。其次，蛋白产量较低，反应通常在几小时内终止，产量（0.1-1 mg/mL）远低于细胞表达系统（如大肠杆菌可达10 mg/mL以上）。此外，复杂蛋白表达受限，原核裂解物缺乏真核翻译后修饰能力（如糖基化），而真核裂解物成本更高；部分蛋白可能因折叠不完全而丧失活性。技术操作上，反应条件（pH、离子强度等）需精细调控，且线性DNA模板易降解，增加了实验难度。CFPS目前更适合小规模应用，在超长蛋白（>100 kDa）表达和工业化连续生产方面仍面临挑战。未来需通过开发低成本试剂、优化能量再生系统和自动化工艺来突破这些瓶颈。高通量蛋白表达的性价比
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