除了获得载体的滴度及产量，生产慢病毒更关心的指标主要是各种污染物的去除。总DNA污染的去除百分比在99.1-99.84%，总蛋白污染物的去除百分比在99.85-99.9%。针对宿主细胞的DNA（HCD）及蛋白（HCP），有报道其去除百分比分别为99.8%和99.4%。因为不仅残存的DNA可能是个问题，而且DNA的大小以及由此引起的可能转移整个有功能的开放阅读框也是问题，因此监管机构对残存DNA污染的分子量上限的要求越来越高。例如，FDA的指南‘生产用于传染病适应症的病毒疫苗的细胞基质和其他生物材料的特性和鉴定’中说明，残留的细胞宿主的DNA片段不能超过一个功能基因的长度，估计在200bp左右。一般来说，生理盐条件相当于150mM NaCl溶液，而这正是中盐核酸酶较为适合的条件。江苏等渗条件中盐核酸酶70950-150
核酸酶活性受到很多因素影响，如盐浓度、pH、底物、温度等。因此，不同客户、不同项目中核酸酶的使用条件都不一。目前，生物制药行业对Benonase全能核酸酶的使用比较熟悉，如生理盐或低盐浓度、脱盐操作等。对于大部分使用Benzonase的项目，使用M-SAN HQ中盐核酸酶可以完全替代，而且温度、Mg2+浓度等条件不用做任何调整，同样酶量的M-SAN HQ对宿主细胞DNA（HCD）的去除效果更好、病毒载体得率更高。经过工艺优化后，可以将M-SAN HQ中盐核酸酶的用量减少到原来的1/3-1/2，且HCD去除效果及产品得率更高。培养基条件中盐核酸酶M-SAN HQ中盐核酸酶用在生产工艺流程中，在生理盐条件下去除双链及单链的DNA及RNA。
在生物工艺流程中，需要使用核酸酶去除终产品中的核酸污染，而核酸酶作为外源成份，也需要在生产流程中去除。核酸酶去除工艺包括热灭活法、酶抑制剂、离子交换和亲合层析法等。慢病毒LV的pI在6.0-6.5左右，包装了完整基因组DNA后的AAV病毒颗粒PI大致为5.9，来自于S.marcescens的全能核酸酶pI 6.85左右，M-SAN HQ中盐核酸酶pI 8.7左右。因此，在同样的条件下，从LV/AAV溶液中去除M-SAN HQ中盐核酸酶比去除Benzonase全能核酸酶更容易、更彻底。
细胞基因药物领域的进展使得对高质量基因转移技术的需求急剧增加，包括高质量慢病毒载体(LV)的大规模生产。宿主细胞DNA残留（HCD）是一类主要的工艺相关杂质，对下游纯化带来很大挑战。根据相关法规要求，需要去除HCD才能达到临床级LV。HCD去除是通过核酸酶处理联合下游工艺（DSP）共同实现的。文章作者研究了两款核酸酶M-SAN HQ中盐核酸酶(ArcticZymes Technologies)和Benzonase(Merck)对HCD去除效率的差别，其下游工艺包含过滤澄清及TFF超滤。鉴于biologics制品更严格的质量要求，厂家对M-SAN HQ中盐核酸酶的生产及质控符合更高标准。
细胞基因药物的基因递送有病毒及非病毒两种方式，其中病毒递送更为常用。在病毒递送路径中，腺相关病毒（AAV）和慢病毒（Lentivirus）是常用的两种载体；差别是病毒基因组的存在形式，AAV的基因组一般不整合到染色体中，以游离形式存在于染色体之外，且一般会表达数年之久；而慢病毒的基因组则会整合到染色体达到长期持续表达的目的。此外，其它用于基因药物的病毒载体有单纯疱疹病毒（HSV）、痘苗病毒（Vaccina Virus）、痘病毒（Poxviruses）。相比于全能核酸酶，在生理盐条件下M-SAN HQ中盐核酸酶将染色质DNA剪切成更小片段的效率更高。吉林中盐核酸酶70950
ArcticZymes Technologies旨在是研究和开发具有独特特性的酶。江苏等渗条件中盐核酸酶70950-150
通过三质粒瞬转体系生产病毒载体，会引入宿主细胞DNA残留（HCD）、蛋白残留（HCP）、工艺杂质（如antibiotics、核酸酶等外源物质）等污染，存在潜在的致瘤性和免疫原性等风险。药品监管机构一般允许生物制品中存在10ng/dose以下的残留DNA。此外，根据杂质来源、工艺以及产品类型不同，也会对HCD限度做不同要求。为了达到这个要求，一般通过核酸酶处理和色谱联用的方法。一般在细胞培养液裂解/收获、澄清收获及超滤浓缩等环节加入核酸酶处理，需要工艺摸索来确认处理方式。江苏等渗条件中盐核酸酶70950-150
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