通过三质粒瞬转体系生产病毒载体，会引入宿主细胞DNA残留（HCD）、蛋白残留（HCP）、工艺杂质（如antibiotics、核酸酶等外源物质）等污染，存在潜在的致瘤性和免疫原性等风险。药品监管机构一般允许生物制品中存在10ng/dose以下的残留DNA。此外，根据杂质来源、工艺以及产品类型不同，也会对HCD限度做不同要求。为了达到这个要求，一般通过核酸酶处理和色谱联用的方法。一般在细胞培养液裂解/收获、澄清收获及超滤浓缩等环节加入核酸酶处理，需要工艺摸索来确认处理方式。SAN HQ高盐核酸酶的改善效果与血清型无关。高盐核酸酶
由于Triton X-100的降解产物对环境影响很大，自2023年12月22日起，欧盟将禁止使用Triton X-100生产试验性医疗产品等。请注意，含有≤0.1% (w/w) Triton X-100表面活性剂的物质不被视为危险物质，仍然可以进口到欧洲。由于该产品通常不用作生物制品或先进疗法的赋形剂，因此在欧洲以外生产的大多数药物在其开发商考虑在欧盟生产之前不需要生产变更。此外，已经获得许可的药物及其赋形剂不受该规则约束。所有其它希望在欧盟生产生物药物和研究产品的生产商都必须寻求Triton X-100的替代品并验证它们对各自用途的适用性。为了支持客户项目更好在欧盟区域申报上市，ArcticZymes Technologies于2019年推出了Triton X-100 Free的SAN HQ TF高盐核酸酶。与SAN HQ高盐核酸酶相比，SAN HQ TF用Tween-20替代了Triton X-100，酶活性能完全一致。目前，SAN HQ和SAN HQ TF都有项目在临床阶段，相关性能都得到了行业客户的认可。陕西SAN HQ TF高盐核酸酶70921-202SAN HQ具有合规的资质及完善的文件体系，支持制药领域严格的监管要求。
综合腺相关病毒AAV制备的三个工艺阶段介绍，可以看出下游处理可以占病毒生产总成本的很大一部分，而且难度也是非常大，尤其是纯化过程。原因之一是由于有超过100种不同血清型的变体AAV衣壳，不同血清型的AAV蛋白存在差异。因此，各种血清型的表面特性增加AAV纯化难度。原因之二是：针对工艺和产品相关的杂质（包括宿主细胞物质，DNA和空衣壳），缺乏一个有效和可重复的平台方法，尤其是来从空衣壳中分离出完整的衣壳。为了解决以上问题，国内外大的药企公司都致力于纯化新产品的开发，以期达到：（1）实现病毒颗粒的分离（2）减少产品相关杂质（3）保持效力和产量的目标。
有研究发现，杆状病毒表达载体体系BEV生产的rAAV发生了与293生产体系不同的衣壳蛋白翻译后修饰（post-translationalmodifications,PTMs）。这一差异是否会影响载体趋向性和转导效率还需要进一步验证。除此之外，杆状病毒多重infection会导致载体蛋白VP1、VP2和VP3比例不一致。尽管如此，BEV/Sf9系统仍然是一种颇有吸引力的大规模临床级载体生产策略。随着以后对基因药物需求的增加，AAV载体的需求量也会与日俱增，而BEV系统能够降低AAV的成本，未来还是很有发展潜力的。高盐浓度能够减少目标产物聚集、增加目标产物溶解度及提高目标产物产量。
经典的慢病毒载体（LV）的生产工艺如下，——三质粒系统瞬时转染HEK293细胞系，转染24小时后LV由转染阳性细胞生产并排出到培养上清液中；收获上清培养液后，加入核酸酶去除HCD污染，通过澄清步骤去除大的细胞碎片等杂质；下游纯化步骤分离LV载体，纯化方法包括切向流过滤TFF、色谱纯化及超速离心；纯化后的LV病毒颗粒经过无菌过滤，更换到优化后的配方中，灌装并冷冻保存。每批Car-T生产时取对应量的LV病毒，切忌反复冻融，否则LV病毒会失活。鉴于其在高盐条件下的较高活性，SAN HQ高盐核酸酶在不损失载体产量和活性的情况下改善了下游工艺。陕西SAN HQ TF高盐核酸酶70921-202
SAN HQ高盐核酸酶是一种新型的、耐高盐的工程化内切酶；高盐核酸酶
残留的宿主DNA是生产中产生的杂质，其存在潜在的致瘤性、传染性和免疫原性等风险。相关研究表明，基因的大小普遍在200bp以上，因此大于200bp有可能会有一定的致病性，而且残留DNA片段越大，生物制品的风险等级越高。因此，各国监管机构对其提出了严格要求。美国食品药品监督管理局（FDA）在《关于人类基因zhiliao新产品生产指导文件》中明确指出HCD的片段要小于200bp。2022年5月，国家药品监督管理局药品评审中心（CDE）发布的《体内基因药物产品药学研究与评价技术指导原则（试行）》中也明确指出需对DNA残留量和残留片段大小进行控制，建议尽量将DNA残留片段的大小控制在200bp以下。高盐核酸酶
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