5.微生物肥料不论是做基肥，还是追肥，都不能暴露在土壤表面。由于阳光照射，使微生物的活性下降。6.注意生产日期，放置时间过长的微生物肥料中的微生物的活性下降。7.冬春季保护地中的地温低，低温微生物的生长繁殖变慢、活性下降。应提高地温，用秸秆覆盖，有利于提高地温，增强微生物活性的作用。微生物菌肥有明显减少蔬菜体内硝酸盐，亚硝酸盐和重金属含量，提高化肥利用率以及培肥土壤等作用，我们应做好微生物菌肥的合理化施用。分解土壤中有机质，可减少氮素的流失，解钾溶磷提高肥料利用率，降低生产投入，减少资源浪费。北京便宜生物菌肥技术指导
生物菌肥的作用：一个是促进土壤中团粒结构的形成，土壤团粒结构好了，理化性状就好，再一个土壤疏松，消除板结，还能增强土壤的透气性，提高保水保肥能力，生物菌肥有很多，把它叫成松土精，顾名思义，它能活化土壤，也有叫免深耕的，也有叫透气肥的，也有叫土壤调理剂的，从表面上看，生物菌肥对土壤是非常好的，有一定改良土壤的作用，第二个是分解有机肥比较好，生物菌肥在活动期间，需要有机物进行分解来繁殖，所以说充分腐熟土壤中的肥料，来减少死棵烂苗现象的发生，一般死棵烂苗都是烧根了，烧苗了这样发生的。海南便宜生物菌肥技术指导这样就抑制和减少了病原的入侵和繁殖机会，起到了减轻作物病害的功效（可以形象理解为“以邪压正”了）。
注意棚温、地温和水温。施用菌肥的比较好温度是25～37℃，低于5℃，高于45℃，施用效果较差。对高温、低温、干旱条件下的农作物田块不宜施用。同时还应掌握固氮菌**适温度，土壤含水量是60～70%左右。因量制宜。对于多年来用化肥的田块施用了生物菌肥不能大量减施化肥和有机肥，因农作物对化肥产生了依赖性，用生物菌肥取代氮肥不能一下子适应，因此，其取代量应做到***、二、三年分别取代30%、40%和60%。磷、钾肥只能补足，不能减少。
种类混乱，分不清使用的是菌剂还是菌肥农用微生物菌剂是指目标微生物（有益菌）经过工业化生产扩繁后制成的活菌制剂；微生物菌肥包含复合微生物肥料和生物有机肥，分别指目的微生物经工业化生产增殖后与营养物质和主要动植物残体（如畜禽粪便、农作物秸秆等）为来源并经无害化处理的有机物料复合而成的活菌制品。菌剂、菌肥比较大的区别在于产品中营养物质及有机物料的含量，使用中需结合实际需求选择对路产品。避免光照直射。光照直射的情况下，一些菌都会杀死。生物菌肥适用于各类农作物的生产，包括粮食作物、蔬菜、果树、经济作物等。
天气虽然影响气温的变化，但是对地温来说，尤其是温室，地面深度越深，受气温影响也就越小。也就是说，即使气温是几度、十几度，但是地温可能保持在十几度、二十度，仍然在生物菌的活性范围内。对生物菌活性来说，中温高湿的环境适宜繁殖，秋季土壤墒情在一年四季当中都是相对很好的，土壤湿度、土壤温度都适合生物菌的大量繁殖。所以在秋季施用菌肥对作物有明显的促进作用，尤其是对果树来说，因为秋季是根系的第三个高峰生长期，施用菌肥会促进根系生长，促进树体发育。地温提升1℃，对土壤当中的微生物活性、种子发芽及生长发育都有很大的影响，我们致力于为广大农业生产者提供高质量的产品和服务，共同推动农业可持续发展。北京便宜生物菌肥技术指导
因此，微生物菌剂与有机肥搭配施用，可将肥效达到1+1＞2的效果。北京便宜生物菌肥技术指导
有机肥存在粉剂和颗粒之分，生产颗粒有机肥有的也的确要经过高温，但是请注意：高温生产颗粒生物有机肥的工艺，并不是把菌种添加放在高温环节之前，而是放在高温环节之后。也就是在经过高温成粒之后，再将微生物菌剂喷在颗粒表面，这样做就保证了颗粒生物菌肥既成粒，又保持了菌种的存活率。另外，颗粒菌肥有的生产工艺并不需要经过高温，比如圆盘造粒、挤压造粒等。这些物理造粒工艺，是将微生物菌直接添加在粉状有机物中，成粒后并没有破坏微生物菌的活性。造粒后再加菌、加菌后不经过高温进行物理造粒，都是完全可行的、成熟的工艺，不存在颗粒状微生物菌剂是假的，粉状微生物菌剂是真的这样的说法。北京便宜生物菌肥技术指导
