医院信息系统属于世界上现存的企业及信息系统中较为复杂的一类，这是医院本身的目标、任务和性质决定的；它应用于医院的医疗管理、经济管理等各个方面，牵涉的信息种类十分庞杂；它融合了医院的管理思想和各部门的业务经验，是医院当前运作方式和业务流程的具体体现，同时又在一定程度上反作用于医院当前的运作方式和业务流程：他实施的技术手段与当前快速发展的信息技术密切相关，实施的广度和深度（如电子日历、电子支付等）又受到社会大环境信息化程度的影响，受到国家和有关部委制定的法律法规的影响。因此，医院信息化建设工作具有长期性、复杂性和内容的多变性；医院信息系统不是一个简单的、封闭的、静止的软件，而是一个复杂的、开放的、在应用的深度和广度上逐步变化和发展的软件系统。医院信息系统以功能完善和流程优化为中心，加速医院内部各种信息的传递。浙江中小医院日常运营系统
医院信息系统数据技术规范要求：1、数据输入：提供数据输入准确、快速、完整性的操作手段，实现应用系统在数据源发生地一次性输入数据技术。2、数据共享：必须提供系统数据共享功能。3、数据通信：必须具备通过网络自动通信交换数据的功能，避免通过介质(软盘、磁带、光盘……)交换数据。4、数据备份：具备数据备份功能，包括自动定时数据备份，程序操作备份和手工操作备份。为防止不可预见的事故及灾害，数据必须异地备份。5、数据恢复：具备数据恢复功能，包括程序操作数据恢复和手工操作数据恢复。6、数据字典编码标准；数据字典包括国家标准数据字典、行业标准数据字典、地方标准数据字典和用户数据字典。江苏大型HIS医院信息系统能收集并存储医院所需全部数据。
医院管理信息系统是医院的管理信息系统，其目标是：一方面支持医院的行政管理与事务处理业务，减轻事务处理人员的劳动强度，辅助医院管理，辅助高层领导决策，提高医院的工作效率，从而使医院能够以少的投入获得更好的社会效益与经济效益，另一方面，支持医院医护人员的临床活动，收集和处理病人的临床医疗信息，丰富和积累临床医学知识，并提供临床咨询、辅助诊疗、辅助临床决策，提高医护人员的工作效率，为病人提供更多、更快、更好的服务。按照各自的功能不同，医院管理信息系统包括：门诊管理系统、住院管理系统、药品管理系统、物资管理系统、OA管理系统、人事管理系统、财务管理系统、医嘱处理系统、医生工作站系统等。
医院信息系统的基本功能：1、信息的加工处理功能系统必须具备对数据的各种加工处理的功能：对已经收集到的信息进行各种各样的加工处理，以完成系统承担的各项业务，使信息更有意义，更能利用。各个部门，各个子系统对数据加工处理的逻辑功能要求各不相同，而且对加工处理的的性能要求也不相同。各事务处理的前线，如窗口、病房对加工处理的速度要求较高。2、信息的传递功能系统必须具备对信息的传递功能：HIS是在全院范围的大规模的网络环境上运行的一个整体，各个部门、各个子系统在系统上处理自身的业务，实现自身的功能时，时刻都在为系统提供各种各样的信息，又时刻都从系统得到各种各样的信息，也就是说，系统时时刻刻都在进行着数据信息的传输。医院信息系统彻底改变了医院信息的收集。
医院管理信息系统总的开发原则是突出“以病人为中心”，在提高医院经济和社会效益及科学管理水平的总目标下，采取平行、分步实施的步骤尽可能实现一个准确、规范、使用、先进、安全可靠、灵活方便的系统。具体指导原则如下：1、整体一致性。本系统应在整体结构上体现出一个基本完整的HIS体系。系统的实现全部满足各医院的总体需求。2、开放集成性。系统应实现利用现有成熟产品和提供其他产品利用本系统的接口。目前已有或即将开发完成的一些比较规范的程序，本系统应能够直接利用。3、安全可靠性。系统应保证数据的安全可靠、保证系统环境、各类操作人员操作维护的安全可靠。4、先进性。本系统地完成，具有国内先进的水平。一套完整的医院信息系统应覆盖医院运行及管理流程的各个方面和各个环节。浙江中小医院日常运营系统
医院信息系统改变了相关的工作流程。浙江中小医院日常运营系统
HIS系统在一个医院的实现后，大体可以分为以下三个阶段：1、管理信息系统一般包括：门、急诊挂号子系统，门、急诊病人管理及计价收费子系统，住院病人管理子系统，药库、药房管理子系统，病案管理子系统，医疗统计子系统，人事、工资管理子系统，财务管理与医院经济核算子系统，医院后勤物资供应子系统，固定资产、医疗设备管理子系统，院长办公综合查询与辅助决策支持系统等。2、临床医疗信息系统包括的内容很多，甚至可能含有专科、专病、专课题的信息处理系统，例如：住院病人医嘱处理子系统，护理信息系统，门诊医生工作站系统，临床实验室检查报告子系统，功能检查科室信息管理子系统，病理卡片管理及病理科信息系统，血库管理子系统，营养与膳食计划管理子系统，临床用药咨询与控制子系统等。3、HIS的高级应用包括：医学图像存档与通信系统，病人床边信息系统，电子病历系统，科研支持系统，教学支持系统，Internet医学情报系统，远程诊断与教学系统等。浙江中小医院日常运营系统
