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医学实验外包之ChIP染色质免疫共沉淀实验, 染色质免疫沉淀的DNA适用于多种分析方法。如果目的蛋白的靶序列是已知的或与染色质免疫沉淀的DNA杂交,来验证目的蛋白与DNA靶序列的特需要验证的,可采用狭缝杂交(Slot blot)的方法,把靶序列特异性探针异性结合。还可以根据靶序列设计引物,用半定量PCR的方法进行测定,或采用Real-time PCR方法进行定量分析。如果目的蛋白的靶序列是未知的或高通量的(high-throughput),可采用Southern杂交。但因为免疫沉淀的DNA量较少,所以在研究时通常要用PCR方法扩增DNA探针,再进行整个基因组扫描。还可以把沉淀的DNA克隆到载体中,进行测序,寻找该序列附近的开放阅读框,发现新的基因调节序列。
医学实验外包,对于很多实验室的老师来说,有些实验难度大,或者是缺乏相应的条件,把实验外包出去,这都是可以理解的。医学实验的一般研究思路,比如发现一个基因在某**细胞系中表达下调,下一步若做机制研究首先,确认是蛋白质水平的下调还是mRNA水平的下调,可以通过westernblot和realtimeRT-PCR来初步确认一下。如果是mRNA水平上就出现下调,那么比较有可能的是这个基因是受这个***的某个信号通路或者是转录因子调控,从而影响它的转录。具体是哪条通路或者是哪几条通路就要多看看paper还有做实验来看了。如果是mRNA水平没有影响,只影响蛋白质水平,那么有可能是蛋白质翻译后修饰或者是蛋白质降解引起的,也是多看看分析一下有可能的降解或者是修饰的途径。另外你再查查有没有这个蛋白与其他蛋白的相互作用研究,可以大致预测是哪条通路。如果没有人做过你就发达了~~还有可以看看你研究的**中是否有发现类似的报道。有个病理上模型的支撑就更加好了。南京实验医学平台一站式医学实验外包平台。

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