根据计算原理，虚拟药物筛选分为基于小分子结构的筛选和基于药物作用机理的筛选两类，前者通过对已知具有相同作用机理的化合物进行定量构效关系研究，绘制出药物的药效团模型，依照模型对化合物数据库进行搜索，这种筛选技术本质上是一种数据库搜索技术；后者主要应用分子对接技术，实施这种筛选需要获知药物作用靶标的分子结构，通过分子模拟手段计算化合物库中的小分子与靶标结合的能力，预测候选化合物的生理活性。 建立合理的药效团模型、准确测定或预测靶标蛋白质的分子结构、精确和快速地计算候选化合物与靶标相互作用的自由能变化是进行虚拟药物筛选的关键，也是限制虚拟筛选准确性的瓶颈。虽然虚拟筛选的准确性有待提高，但是其快速廉价的特点使之成为发展为迅速的药物筛选技术之一。药物高通量筛选平台。重庆高通量筛选法
充分利用药用资源由于高通量筛选依赖数量庞大的样品库，实现了药物筛选的规模化，较大限度地利用了药用物质资源，提高了药物发现的几率，同时提高了发现新药的质量。微量筛选系统由于高通量筛选采用的是细胞、分子水平的筛选模型．样品用量一般在微克级（μg），节省了样品资源，奠定了“一药多筛”的物质基础，同时节省了实验材料，降低了单药筛选成本。高度自动化操作随着对高通量药物筛选的重视程度不断提高，用于高通量药物筛选操作设备和检测仪器都有了长足发展，实现了计算机控制的自动化，减少了操作误差的发生，提高了筛选效率和结果的准确性。多学科理论和技术的结合在高通量筛选过程中，不仅应用了普通的药理学技术和理论，而且与药物化学、分子生物学、细胞生物学、数学、微生物学、计算机科学等多学科紧密结合。这种多学科的有机结合，在药物筛选领域产生大量新的课题和发展机会，促进了药物筛选理论和技术的发展。北京化学高通量筛选高通量筛选的技术优点。
高通量筛选技术是指以分子水平和细胞水平的实验方法为基础，以微板形式作为实验工具载体，以自动化操作系统执行试验过程，以灵敏快速的检测仪器采集实验结果数据，以计算机分析处理实验数据，在同一时间检测数以千万的样品，并以得到的相应数据库支持运转的技术体系，它具有微量、快速、灵敏和准确等特点。简言之就是可以通过一次实验获得大量的信息，并从中找到有价值的信息。高通量筛选时每天要对数以千万的样品进行检测，工作枯燥，步骤单一，操作人员容易疲劳、出错。自动化操作系统由计算机及其操作软件、自动化加样设备、温孵离心设备和堆栈4个部分组成。自动化操作系统代替人工操作显然有诸多优势，它利用计算机通过操作软件控制整个实验过程，编程过程简洁明了。
基于细胞水平的筛选的关键特征之一是可以一次筛选多个靶标。基于细胞的筛选常用于以下情况下：1)所需的分子靶标未知，2)靶标无法在生化测定中充分重组，3)所需的表型只存在于细胞环境中，例如从一种细胞类型分化到另一种细胞类型。基于细胞的检测贯穿于药物发现的所有阶段：靶标选择和验证、初步筛选、先导化合物识别、先导化合物优化以及安全和毒理学筛选。介绍一些细胞水平分析的方法：细胞活力、报告基因、第二信使和高内涵成像等。菌种高通量筛选实验。
开发一种新药的过程可能是漫长、复杂和不确定的，但从社会、科学和经济的角度来看，它也可能是高回报的。高通量筛选(HTS)已经成为药物发现的主要工具。，向大家介绍目前用于靶标确认的几种HTS方法，主要分为两大类:生化水平和细胞水平。生化水平分析包括比率荧光法（FA/FP）、荧光共振能量转移（FRET）、时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)等；细胞水平的分析包括细胞活力、报告基因、第二信使和高内涵成像等。生化筛选利用纯化的目标蛋白，在体外测定配体的结合或酶活性的抑制。这些检测通常在384孔板中以竞争的形式进行，其中所研究的化合物必须取代已知的配体或底物。荧光法由于其使用简便、灵敏度高和灵活性强等特点，广受科研人员的欢迎，主要有比率荧光法（FA/FP）、荧光共振能量转移（FRET）、时间分辨荧光共振能量转移(TR-FRET)。高通量筛选技术的靶点是。重庆高通量筛选法
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